01 高通量空间转录组学研究正日益受到重视 转录组学市场正日益从传统的RNA测序转向空间分析方法，这种方法能够在测量基因表达的同时保留细胞在组织中的位置信息。空间信息使研究人员能够了解相邻细胞群之间的相互作用，以及分子活性在肿瘤、器官和其他复杂结构中的变化。通量的提高使得这些工作流程不再局限于孤立的实验，而是适用于更大的组织区域和研究队列。因此，高通量空间分析正成为转录组学市场发展趋势的重要组成部分。 2026年4月，10x Genomics推出了用于全转录组原位分析的Atera空间平台。该系统设计用于在单台仪器上每年处理超过1亿个细胞，同时提供大型组织样本的单细胞基因表达信息。
02 转录组学与蛋白质组学的整合日益增强 研究人员越来越倾向于在同一生物样本中同时测量RNA和蛋白质，而不是分别分析各个分子层。整合这些数据集可以揭示基因表达的变化是否转化为相应的细胞功能，并能更全面地了解疾病通路和治疗反应。对同一样本进行分析还能减少因比较不同组织切片而产生的变异性。因此，RNA-蛋白质整合正在推动转录组学产业向多维生物学分析方向发展。 2025 年 4 月，布鲁克公司扩展了 CosMx 空间分子成像仪，使其具备了在同一载玻片上进行多组学分析的功能，该功能可以将大约 19,000 个全转录组 RNA 靶标与多达 76 个蛋白质靶标以单细胞和亚细胞分辨率结合起来。
01 单细胞研究的扩展增加了测序需求 批量RNA测序会对大量细胞的分子信号进行平均，这可能会掩盖稀有细胞群或单个细胞间的重要差异。因此，研究人员越来越多地利用单细胞转录组学来研究免疫反应、发育通路、肿瘤异质性和疾病相关的细胞状态。更大规模的研究需要能够处理更多细胞并保持可靠分子信息的技术。因此，单细胞研究的扩展正在推动转录组学市场需求的增长。
01 大型RNA数据集造成生物信息学瓶颈 现代单细胞实验会产生庞大的表达矩阵，需要进行质量控制、标准化、聚类、注释、差异表达分析和生物学解释。当缺乏计算基础设施或专业人员时，实验室生成测序信息的速度往往快于分析速度。生物信息学专业技术有限。随着研究涉及更多细胞和样本，存储和处理要求也随之增加。因此，尽管测序通量有所提高，但计算复杂性仍可能制约转录组学市场的增长。
01 三维转录组图谱的扩展 大多数空间工作流程分析的是薄组织切片，只能提供二维视角，而生物结构实际上存在于三维空间中。直接进行三维分析可以揭示细胞邻域、组织边界、肿瘤侵袭模式以及分子梯度等信息，而这些信息在通过计算重建单个切片时可能会被忽略。这为神经科学、发育生物学和癌症研究等领域开辟了新的应用。因此，三维分子图谱可以帮助技术提供商提升转录组学市场份额。
01 在样品制备过程中保持RNA质量 RNA比DNA更容易降解，因此样本的采集、储存、固定、提取和处理对转录组学的准确性至关重要。降解的分子会降低转录本的检出率，并引入偏差，这在研究人员比较不同条件下采集的临床样本时尤为突出。存档组织也带来了额外的难题，因为固定过程可能会导致RNA片段化或发生化学修饰。因此，随着转录组学市场规模向转化研究领域扩展，如何在各种样本类型中保持可用的分子信息仍然是一项重大挑战。
2026年1月：布鲁克公司完成了对 NanoString Technologies 的收购，通过将 NanoString 的分子分析技术与布鲁克的生命科学仪器相结合，加强了其空间生物学和转录组学产品组合。