01 Zunehmender Trend hin zur hochauflösenden Shotgun-Metagenomsequenzierung Der Markt für die Sequenzierung des Krebsmikrobioms entwickelt sich zunehmend weg von der einfachen 16S-rRNA-Profilierung hin zur Shotgun-Metagenomik, die mikrobielle Gemeinschaften auf Arten- und Stammebene charakterisieren und gleichzeitig funktionelle Gene und Stoffwechselwege identifizieren kann. Hochauflösende Metagenomik wird daher zu einem wichtigen Bestandteil der Markttrends in der Krebsmikrobiomsequenzierung. Im September 2025 wählte PacBio aus Hunderten von Anträgen vier Projekte für sein Microbiome SMRT Grant-Programm 2025 aus. Ein Projekt wendet speziell die HiFi-Shotgun-Metagenomsequenzierung auf Stuhlproben von Patienten mit kolorektalen Adenomen an, um metagenomische Genome zu rekonstruieren und die mikrobielle Beteiligung an der Progression zu Darmkrebs zu untersuchen.
02 Zunehmende Integration der Langsequenzierung in onkologische Arbeitsabläufe Studien zum Krebsmikrobiom benötigen zunehmend Sequenzierungstechnologien, die komplexe mikrobielle Genome, Strukturvariationen und gemischte biologische Signale neben tumorbezogenen molekularen Informationen auflösen können. Die Langsequenzierung ermöglicht vollständigere Genom-Assemblierungen und verbessert die Identifizierung von Mikroorganismen, die mit fragmentierten Kurzsequenzen schwer zu charakterisieren sind. Die Integration in etablierte Anreicherungs- und Analyseprozesse in der Onkologie trägt somit dazu bei, die Krebsmikrobiom-Sequenzierungsbranche hin zu einer umfassenderen translationalen Forschung zu erweitern. Im Mai 2026 erweiterte Oxford Nanopore Technologies sein kompatibles Sequenzierungs-Ökosystem um die Bereiche Onkologie, Pathogenforschung und Multi-Omics-Workflows. Das Programm fügte die Kompatibilität mit der gezielten Anreicherung Agilent SureSelect hinzu und erweiterte die Echtzeitsequenzierung beliebiger Länge auf drei Hauptbereiche: Onkologie, Pathogenforschung und Multi-Omics.
01 Zunehmende Hinweise auf einen Zusammenhang zwischen dem Mikrobiom und der Krebsentstehung Forscher identifizieren mikrobielle Gemeinschaften in Tumoren und im Magen-Darm-Trakt, die möglicherweise mit Krebs in Verbindung stehen. Dies erhöht den Bedarf, Bakterien, Pilze, Viren und andere Mikroorganismen zusammen mit Wirts- und Tumorinformationen zu sequenzieren. Da Mikrobiom-Signaturen immer enger mit verschiedenen Krebsarten verknüpft werden, benötigen Labore zunehmend ausgefeilte Sequenzierungs- und Computer-Workflows. Die wachsende Evidenz zu Tumor-Mikroben-Interaktionen stärkt daher die Marktnachfrage nach der Sequenzierung des Krebsmikrobioms.
01 Ein hoher Anteil an Wirts-DNA erhöht die Kosten der Sequenzierung. Tumorgewebe, Blut und andere menschliche Proben können deutlich mehr Wirts-DNA als mikrobielle DNA enthalten. Werden Proben ohne effektive Entfernung der Wirts-DNA sequenziert, kann ein großer Anteil der Sequenzdaten menschliches genetisches Material anstelle von Mikroorganismen repräsentieren, was eine deutlich tiefere Sequenzierung erfordert, um ausreichend mikrobielle Informationen zu erhalten. Dies erhöht die Kosten für Reagenzien, Sequenzierung, Lagerung und Bioinformatik. Eine geringe mikrobielle Dichte kann folglich das Wachstum des Marktes für die Sequenzierung des Krebsmikrobioms hemmen, da hochwertige Tumormikrobiomstudien dadurch teuer werden.
01 Erweiterung der Mikrobiomsequenzierung zur Darmkrebsfrüherkennung Darmkrebs bietet eine bedeutende Chance, da Stuhlproben einen nicht-invasiven Zugang zu den mit dem Magen-Darm-Trakt assoziierten Mikroorganismen ermöglichen. Die Sequenzierung dieser Mikroorganismen kann potenziell Kombinationen von Arten und funktionellen Signaturen identifizieren, die mit Krebsvorstufen oder Krebs in Zusammenhang stehen. Ein mikrobiombasiertes Screening könnte bestehende Stuhl- und Koloskopieverfahren ergänzen und eine personalisierte Risikobewertung unterstützen. Nicht-invasive Darmkrebsvorsorge kann spezialisierten Anbietern somit helfen, ihren Marktanteil im Bereich der Krebs-Mikrobiomsequenzierung zu steigern.
01 Interpretation komplexer mikrobieller Signale aus verschiedenen Reichen Tumorassoziierte Mikrobiome können Bakterien, Pilze, Viren, Archaeen und andere Mikroorganismen enthalten, deren Häufigkeit je nach Patient, Tumorart, anatomischer Lokalisation, Behandlung und Population erheblich variieren kann. Der alleinige Nachweis mikrobieller DNA reicht nicht aus, um festzustellen, ob ein Organismus zum Tumor beiträgt, auf die Tumorumgebung reagiert oder eine Kontamination darstellt. Forscher benötigen daher große Datensätze und fortgeschrittene Bioinformatik, um aussagekräftige biologische Signale von Hintergrundvariationen zu unterscheiden. Die zuverlässige Interpretation bleibt eine große Herausforderung, da der Markt für die Sequenzierung von Krebsmikrobiomen in Richtung translationaler Anwendungen wächst.
Januar 2026:Illumina hat Connected Multiomics eingeführt, eine cloudbasierte Analyse- und Interpretationsplattform, die integrierte Multiomics-Workflows unterstützt. Die Software ermöglicht die skalierbare Analyse und Visualisierung komplexer biologischer Datensätze, unter anderem für Anwendungen in der Onkologie und der Mikrobiomforschung.
Januar 2026:QIAGEN hat drei automatisierte Probenvorbereitungssysteme für die Markteinführung im Jahr 2026 angekündigt, die auf Anwendungen mit hohem Durchsatz abzielen, darunter Mikrobiomforschung, Flüssigbiopsie und Arbeitsabläufe in der Onkologie.
Mai 2025:MapmyGenome übernahm Microbiome Insights, einen kanadischen Spezialisten für mikrobielle Sequenzierung mit einem CAP-akkreditierten Labor und umfassendem Know-how im Bereich Mikrobiomforschung. Durch die Übernahme erweiterte MapmyGenome seine Kompetenzen in der mikrobiellen Sequenzierung und Mikrobiomanalyse und stärkte seine internationalen Genomik-Aktivitäten.