01 Zunehmender Trend hin zur räumlichen Hochdurchsatz-Transkriptomik Der Markt für Transkriptomik verlagert sich zunehmend von der konventionellen RNA-Sequenzierung hin zu räumlichen Ansätzen, die die Genexpression unter Beibehaltung der Zellposition innerhalb des Gewebes messen. Räumliche Informationen ermöglichen es Forschern, die Interaktionen benachbarter Zellpopulationen und die Veränderungen der molekularen Aktivität in Tumoren, Organen und anderen komplexen Strukturen zu verstehen. Der steigende Durchsatz macht diese Arbeitsabläufe für größere Gewebebereiche und Forschungskohorten geeignet, anstatt für isolierte Experimente. Hochdurchsatz-Räumlichkeitsanalysen werden daher zu einem wichtigen Bestandteil der Marktentwicklung in der Transkriptomik. Im April 2026 stellte 10x Genomics seine Atera-Plattform für die In-situ-Analyse des gesamten Transkriptoms vor. Das System ist darauf ausgelegt, jährlich über 100 Millionen Zellen mit einem einzigen Gerät zu verarbeiten und gleichzeitig Einzelzell-Genexpressionsinformationen aus großen Gewebeproben zu liefern.
02 Zunehmende Integration von Transkriptomik und Proteomik Forscher möchten zunehmend RNA und Proteine innerhalb derselben biologischen Probe messen, anstatt einzelne Molekülschichten separat zu analysieren. Die Kombination dieser Datensätze kann aufzeigen, ob Veränderungen der Genexpression mit entsprechenden Zellfunktionen einhergehen und ein umfassenderes Bild von Krankheitswegen und Therapieansprechen liefern. Die Analyse derselben Probe reduziert zudem die Variabilität, die beim Vergleich verschiedener Gewebeschnitte auftritt. Die Integration von RNA und Protein erweitert somit die Transkriptomik hin zu multidimensionalen biologischen Profilen. Im April 2025 erweiterte Bruker den CosMx Spatial Molecular Imager um Multiomics-Funktionen auf demselben Objektträger, die etwa 19.000 RNA-Zielsequenzen des gesamten Transkriptoms mit bis zu 76 Protein-Zielsequenzen auf Einzelzell- und subzellulärer Ebene kombinieren.
01 Die Ausweitung der Einzelzellforschung erhöht die Sequenzierungsanforderungen. Die Bulk-RNA-Sequenzierung mittelt molekulare Signale über viele Zellen hinweg und kann seltene Zellpopulationen oder wichtige Unterschiede zwischen einzelnen Zellen verbergen. Daher nutzen Forschende zunehmend die Einzelzell-Transkriptomik, um Immunreaktionen, Entwicklungsprozesse, Tumorheterogenität und krankheitsassoziierte Zellzustände zu untersuchen. Größere Studien erfordern Technologien, die deutlich mehr Zellen verarbeiten können und gleichzeitig zuverlässige molekulare Informationen liefern. Die Ausweitung der Einzelzellforschung stärkt somit die Marktnachfrage nach Transkriptomik.
01 Große RNA-Datensätze schaffen Engpässe in der Bioinformatik. Moderne Einzelzell-Experimente erzeugen große Expressionsmatrizen, die Qualitätskontrolle, Normalisierung, Clustering, Annotation, Differenzialexpressionsanalyse und biologische Interpretation erfordern. Labore können Sequenzierungsinformationen schneller generieren, als sie diese analysieren können, wenn die Recheninfrastruktur oder die spezialisierten Fachkräfte nicht ausreichen.BioinformatikDas Fachwissen ist begrenzt. Auch der Bedarf an Lagerung und Verarbeitung steigt mit zunehmender Zell- und Probenanzahl in den Studien. Die Rechenkomplexität kann daher das Wachstum des Transkriptomik-Marktes trotz verbesserter Sequenzierungsraten bremsen.
01 Erweiterung der dreidimensionalen Transkriptomkartierung Die meisten räumlichen Arbeitsabläufe analysieren dünne Gewebeschnitte und liefern damit lediglich eine zweidimensionale Ansicht biologischer Strukturen, die natürlicherweise dreidimensional existieren. Die direkte 3D-Analyse kann zelluläre Nachbarschaften, Gewebegrenzen, Tumorinvasionsmuster und molekulare Gradienten sichtbar machen, die bei der computergestützten Rekonstruktion einzelner Schnitte möglicherweise übersehen werden. Dies eröffnet neue Anwendungsmöglichkeiten in der Neurowissenschaft, der Entwicklungsbiologie und der Krebsforschung. Dreidimensionale molekulare Kartierung kann Technologieanbietern daher helfen, ihren Marktanteil im Bereich der Transkriptomik auszubauen.
01 Erhaltung der RNA-Qualität während der Probenvorbereitung RNA degradiert leichter als DNA, weshalb Probenentnahme, -lagerung, -fixierung, -extraktion und -verarbeitung entscheidend für die Genauigkeit der Transkriptomik sind. Degradierte Moleküle können die Transkriptnachweisbarkeit beeinträchtigen und zu Verzerrungen führen, die besonders problematisch sind, wenn Forschende klinische Proben vergleichen, die unter verschiedenen Bedingungen gewonnen wurden. Archiviertes Gewebe stellt eine zusätzliche Schwierigkeit dar, da die Fixierung RNA fragmentieren oder chemisch modifizieren kann. Die Erhaltung nutzbarer molekularer Informationen über verschiedene Probentypen hinweg bleibt daher eine große Herausforderung, da der Markt für Transkriptomik in die translationale Forschung expandiert.
April 2026 10x Genomics hat die neueste Version seiner Visium HD Spatial Gene Expression Plattform vorgestellt, die eine höher auflösende Transkriptomprofilierung zur Unterstützung der Forschung in den Bereichen Onkologie, Neurowissenschaften und Biomarker-Entdeckung bietet.
Juni 2026:Illumina hat einen erweiterten Workflow für die Einzelzell- und räumliche Transkriptomik eingeführt, der die Sequenzierung der nächsten Generation mit fortschrittlicher Bioinformatik integriert, um die Genexpressionsanalyse für die translationale und klinische Forschung zu verbessern.
Januar 2026:Die Bruker Corporation hat die Übernahme von NanoString Technologies abgeschlossen und damit ihr Portfolio im Bereich räumliche Biologie und Transkriptomik gestärkt, indem sie die molekularen Profilierungstechnologien von NanoString mit den Life-Science-Instrumenten von Bruker kombiniert hat.
Oktober 2025:Standard BioTools Inc. (ehemals Fluidigm) hat neue High-Plex-Transkriptomik-Workflows eingeführt, die fortschrittliche Einzelzellanalyse und Multi-Omics-Funktionen für die lebenswissenschaftliche Forschung integrieren.