01 ハイスループット空間トランスクリプトミクスへの移行の拡大 トランスクリプトミクス市場は、従来のRNAシーケンスから、組織内の細胞の位置を保持しながら遺伝子発現を測定する空間的アプローチへと移行しつつあります。空間情報を用いることで、研究者は隣接する細胞集団がどのように相互作用し、腫瘍、臓器、その他の複雑な構造全体で分子活性がどのように変化するかを理解することができます。スループットの向上により、これらのワークフローは、個別の実験ではなく、より広い組織領域や研究コホートにも適したものになりつつあります。したがって、ハイスループット空間解析は、トランスクリプトミクス市場の重要なトレンドになりつつあります。 2026年4月、10x Genomics社は、全トランスクリプトームのin situ解析のための空間プラットフォーム「Atera」を発表しました。このシステムは、1台の装置で年間1億個以上の細胞を処理するように設計されており、大規模な組織サンプル全体にわたる単一細胞レベルの遺伝子発現情報を提供します。
02 トランスクリプトミクスとプロテオミクスの統合の進展 研究者たちは、個々の分子層を別々に分析するのではなく、同一の生体試料内でRNAとタンパク質を測定することをますます望んでいる。これらのデータセットを組み合わせることで、遺伝子発現の変化が対応する細胞機能に反映されるかどうかが明らかになり、疾患経路や治療反応についてより包括的な理解が得られる。同一試料の分析は、別々の組織切片を比較する際に生じるばらつきも低減する。結果として、RNAとタンパク質の統合は、トランスクリプトミクス産業を多次元的な生物学的プロファイリングへと拡大させている。 2025年4月、ブルカーはCosMx空間分子イメージャーを拡張し、同一スライド上で約19,000個の全トランスクリプトームRNAターゲットと最大76個のタンパク質ターゲットを単一細胞および細胞内解像度で組み合わせるマルチオミクス機能を追加しました。
01 単一細胞研究の拡大に伴い、シーケンス解析の必要性が高まる バルクRNAシーケンスは多数の細胞にわたる分子シグナルを平均化するため、希少な細胞集団や個々の細胞間の重要な差異を隠してしまう可能性があります。そのため、研究者たちは免疫応答、発生経路、腫瘍の不均一性、疾患関連細胞状態などを調査するために、シングルセル・トランスクリプトミクスをますます活用するようになっています。より大規模な研究には、信頼性の高い分子情報を維持しながら、より多くの細胞を処理できる技術が必要です。したがって、シングルセル研究の拡大は、トランスクリプトミクス市場の需要を押し上げています。
01 大規模なRNAデータセットがバイオインフォマティクスのボトルネックを生み出す 現代のシングルセル実験では、品質管理、正規化、クラスタリング、アノテーション、差次的発現解析、および生物学的解釈を必要とする大規模な発現マトリックスが生成されます。計算インフラや専門家が不足している場合、研究室はシーケンス情報を分析するよりも速く生成できます。バイオインフォマティクス専門知識は限られている。研究対象となる細胞やサンプルが増えるにつれて、保管および処理に必要な要件も増加する。結果として、シーケンス処理能力の向上にもかかわらず、計算の複雑さがトランスクリプトミクス市場の成長を抑制する可能性がある。
01 三次元トランスクリプトームマッピングの拡張 ほとんどの空間解析ワークフローは薄い組織切片を解析するため、本来3次元で存在する生物学的構造を2次元的にしか捉えることができません。直接的な3D解析によって、個々の切片をコンピュータで再構築する際には見落とされがちな細胞間の近接性、組織境界、腫瘍浸潤パターン、分子勾配などを明らかにすることができます。これにより、神経科学、発生生物学、がん研究において新たな応用分野が生まれます。したがって、3次元分子マッピングは、技術プロバイダーがトランスクリプトミクス市場でのシェアを拡大する上で役立つ可能性があります。
01 サンプル調製中のRNA品質の維持 RNAはDNAよりも分解されやすいため、サンプルの採取、保存、固定、抽出、処理はトランスクリプトームの精度にとって極めて重要です。分解された分子は転写産物の検出を低下させ、特に異なる条件下で採取された臨床サンプルを比較する際に問題となるバイアスを生じさせます。保存された組織は、固定によってRNAが断片化または化学的に修飾される可能性があるため、さらに困難を伴います。したがって、トランスクリプトーム市場がトランスレーショナルリサーチへと拡大するにつれ、多様なサンプルタイプにわたって使用可能な分子情報を維持することは、依然として大きな課題となっています。
2026年6月：イルミナは、次世代シーケンシングと高度なバイオインフォマティクスを統合した、拡張されたシングルセルおよび空間トランスクリプトミクスワークフローを発表し、トランスレーショナル研究および臨床研究における遺伝子発現解析を改善した。
2026年4月：10x Genomics社は、腫瘍学、神経科学、バイオマーカー発見研究を支援するため、より高解像度のトランスクリプトームプロファイリングを提供するVisium HD空間遺伝子発現プラットフォームの最新バージョンを発表した。
2026年1月：ブルカー社はナノストリング・テクノロジーズ社の買収を完了し、ナノストリング社の分子プロファイリング技術とブルカー社のライフサイエンス機器を組み合わせることで、空間生物学およびトランスクリプトミクス分野のポートフォリオを強化した。
2025年10月：Standard BioTools Inc.（旧Fluidigm）は、ライフサイエンス研究向けに、高度なシングルセル解析とマルチオミクス機能を統合した、新しい高多重トランスクリプトミクスワークフローを発表しました。