世界のトランスクリプトミクス市場規模は、2025年には82億米ドルと評価され、2026年の86億3000万米ドルから2034年には129億7000万米ドルに成長すると予測されており、2026年から2034年の予測期間における年平均成長率（CAGR）は5.23%となる見込みです。北米は2025年に42.3%の市場シェアを占め、トランスクリプトミクス市場を牽引しました。
トランスクリプトミクスとは、特定の生物学的条件下における遺伝子発現、調節、および細胞活動を理解するために、生物のRNA転写産物の全セットを研究・分析する学問です。RNAシーケンスやマイクロアレイなどの技術を用いてRNA分子を同定・測定します。トランスクリプトミクスは、疾患研究、創薬、精密医療、バイオテクノロジー、分子生物学など幅広い分野で、バイオマーカーの同定、生物学的メカニズムの解明、標的療法の開発支援などに活用されています。
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ハイスループット空間トランスクリプトミクスへの移行の拡大
トランスクリプトミクス市場は、従来のRNAシーケンスから、組織内の細胞の位置を保持しながら遺伝子発現を測定する空間的アプローチへと移行しつつあります。空間情報を用いることで、研究者は隣接する細胞集団がどのように相互作用し、腫瘍、臓器、その他の複雑な構造全体で分子活性がどのように変化するかを理解することができます。スループットの向上により、これらのワークフローは、個別の実験ではなく、より広い組織領域や研究コホートにも適したものになりつつあります。したがって、ハイスループット空間解析は、トランスクリプトミクス市場の重要なトレンドになりつつあります。
2026年4月、10x Genomics社は、全トランスクリプトームのin situ解析のための空間プラットフォーム「Atera」を発表しました。このシステムは、1台の装置で年間1億個以上の細胞を処理するように設計されており、大規模な組織サンプル全体にわたる単一細胞レベルの遺伝子発現情報を提供します。
トランスクリプトミクスとプロテオミクスの統合の進展
研究者たちは、個々の分子層を別々に分析するのではなく、同一の生体試料内でRNAとタンパク質を測定することをますます望んでいる。これらのデータセットを組み合わせることで、遺伝子発現の変化が対応する細胞機能に反映されるかどうかが明らかになり、疾患経路や治療反応についてより包括的な理解が得られる。同一試料の分析は、別々の組織切片を比較する際に生じるばらつきも低減する。結果として、RNAとタンパク質の統合は、トランスクリプトミクス産業を多次元的な生物学的プロファイリングへと拡大させている。
2025年4月、ブルカーはCosMx空間分子イメージャーを拡張し、同一スライド上で約19,000個の全トランスクリプトームRNAターゲットと最大76個のタンパク質ターゲットを単一細胞および細胞内解像度で組み合わせるマルチオミクス機能を追加しました。
単一細胞研究の拡大に伴い、シーケンス解析の必要性が高まる
バルクRNAシーケンスは多数の細胞にわたる分子シグナルを平均化するため、希少な細胞集団や個々の細胞間の重要な差異を隠してしまう可能性があります。そのため、研究者たちは免疫応答、発生経路、腫瘍の不均一性、疾患関連細胞状態などを調査するために、シングルセル・トランスクリプトミクスをますます活用するようになっています。より大規模な研究には、信頼性の高い分子情報を維持しながら、より多くの細胞を処理できる技術が必要です。したがって、シングルセル研究の拡大は、トランスクリプトミクス市場の需要を押し上げています。
2025年2月、Parse Biosciences社は、特殊なマイクロ流体機器を必要とせずに、数千個から数百万個の細胞を対象とした実験を処理できる拡張性の高いワークフローを追加することで、Evercodeのシングルセル製品群を拡充しました。
大規模なRNAデータセットがバイオインフォマティクスのボトルネックを生み出す
現代のシングルセル実験では、品質管理、正規化、クラスタリング、アノテーション、差次的発現解析、および生物学的解釈を必要とする大規模な発現マトリックスが生成されます。計算インフラや専門家が不足している場合、研究室はシーケンス情報を分析するよりも速く生成できます。バイオインフォマティクス専門知識は限られている。研究対象となる細胞やサンプルが増えるにつれて、保管および処理に必要な要件も増加する。結果として、シーケンス処理能力の向上にもかかわらず、計算の複雑さがトランスクリプトミクス市場の成長を抑制する可能性がある。
2025年7月、QIAGENは複雑なオミクス解析のためのバイオインフォマティクス機能であるDigital Insightsを拡張しました。同社の知識基盤には、10万件を超える手作業でキュレーションされた分子間の関係が含まれており、大規模な実験データセットを生物学的経路や疾患メカニズムと結びつけるために利用できます。
三次元トランスクリプトームマッピングの拡張
ほとんどの空間解析ワークフローは薄い組織切片を解析するため、本来3次元で存在する生物学的構造を2次元的にしか捉えることができません。直接的な3D解析によって、個々の切片をコンピュータで再構築する際には見落とされがちな細胞間の近接性、組織境界、腫瘍浸潤パターン、分子勾配などを明らかにすることができます。これにより、神経科学、発生生物学、がん研究において新たな応用分野が生まれます。したがって、3次元分子マッピングは、技術プロバイダーがトランスクリプトミクス市場でのシェアを拡大する上で役立つ可能性があります。
2026年2月、ステラロミクス社は、組織をそのままの状態で3D空間トランスクリプトミクス解析を行うためのプラットフォーム「Pyxa」を発表しました。このプラットフォームは、最大100マイクロメートルの厚さの試料を、細胞および分子の三次元構造を維持したまま解析することができます。
サンプル調製中のRNA品質の維持
RNAはDNAよりも分解されやすいため、サンプルの採取、保存、固定、抽出、処理はトランスクリプトームの精度にとって極めて重要です。分解された分子は転写産物の検出を低下させ、特に異なる条件下で採取された臨床サンプルを比較する際に問題となるバイアスを生じさせます。保存された組織は、固定によってRNAが断片化または化学的に修飾される可能性があるため、さらに困難を伴います。したがって、トランスクリプトーム市場がトランスレーショナルリサーチへと拡大するにつれ、多様なサンプルタイプにわたって使用可能な分子情報を維持することは、依然として大きな課題となっています。
2026年5月、タカラバイオは、困難なサンプルや低インプットサンプルに対応するSMART-Seqトランスクリプトミクスワークフローを拡張し、ピコグラムレベルのインプットからのRNA解析をサポートするとともに、高品質の生物学的材料がごく少量しか入手できない場合にも対応できるようにしました。
消耗品セグメントは2025年に45.8%のシェアを占め、市場を席巻するだろう。
消耗品セグメントは、2025年に45.8%の市場シェア（37億6,000万米ドル）を占め、世界のトランスクリプトミクス市場を牽引しました。この優位性は、トランスクリプトミクスワークフロー全体で使用される試薬、アッセイコンポーネント、シーケンス材料、サンプル調製製品、その他の消耗品に対する継続的なニーズによって支えられています。研究活動の活発化とハイスループット分子解析の利用拡大が、これらの製品に対する持続的な需要に貢献しています。
機器、ソフトウェア、サービスは、サンプル処理、シーケンス、データ解析、解釈を可能にすることで、トランスクリプトミクスワークフローを継続的にサポートしています。研究室や研究機関が、より高度なトランスクリプトミクス技術を研究プログラムに取り入れるにつれて、これらの機器やサービスの普及は拡大しています。
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次世代シーケンシング（NGS）分野は、2025年に46.9%のシェアを占め、市場を席巻するだろう。
次世代シーケンシング（NGS）分野は、2025年には世界のトランスクリプトミクス市場において46.9%の市場シェアを占め、市場規模は38億5000万米ドルに達すると予測されています。NGSはRNAおよび遺伝子発現のハイスループット解析を可能にするため、トランスクリプトームプロファイリングや分子生物学研究において重要な技術となっています。大量の遺伝子情報を効率的に解析できるその能力は、研究、創薬、疾患関連研究など幅広い分野での採用拡大を後押ししています。
ポリメラーゼ連鎖反応、マイクロアレイ、その他の技術は、引き続き特殊なトランスクリプトーム研究のニーズに応えています。これらの手法は、標的分析、遺伝子発現研究、検証、および特定の分析ワークフローが求められる用途において、依然として有効です。
診断および疾患プロファイリング分野は、年平均成長率（CAGR）14.6%で最も速い成長を記録すると予測されている。
診断および疾患プロファイリング分野は、予測期間中に年平均成長率（CAGR）14.6%で最も速い成長を遂げると予測されています。疾患メカニズムの解明、分子シグネチャの特定、患者の生物学的特性の理解向上を目的としたトランスクリプトーム解析の利用拡大が、この分野の需要を支えています。シーケンス技術と計算解析の進歩により、研究者はさまざまな疾患に関連する遺伝子発現パターンをさらに詳細に調べることができるようになっています。
トランスクリプトームデータは、研究者が生物学的経路を理解し、潜在的な治療標的を特定し、治療に対する分子レベルの反応を評価するのに役立つため、創薬・開発は依然として主要な応用分野である。その他の応用分野も、多様な生物学的研究活動における市場拡大に貢献している。
バイオテクノロジー企業セグメントは、年平均成長率（CAGR）15.2%で最も速い成長を記録すると予測されている。
バイオテクノロジー企業セグメントは、予測期間中に年平均成長率（CAGR）15.2%で最も速い成長を遂げると予測されています。バイオテクノロジー企業は、バイオマーカーの発見、治療研究、分子特性解析、革新的な生物学的製品の開発にトランスクリプトミクスをますます活用しています。シーケンス技術と計算技術の統合が進むにつれ、これらの企業は複雑な遺伝子発現データを生成・解釈する能力を拡大しています。
学術機関や研究機関は、基礎生物学研究や疾患研究におけるトランスクリプトミクスの広範な利用によって支えられ、依然として主要なエンドユーザーグループである。製薬会社もまた、創薬、開発、標的同定、治療反応の調査を支援するために、トランスクリプトミクスのアプローチを採用し続けている。
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北米のトランスクリプトミクス市場は、世界市場の42.3%を占め、2025年には34億7000万米ドルに達すると予測されており、予測期間中の年平均成長率（CAGR）は11.8%と見込まれています。この地域が市場をリードする地位にある背景には、高度なゲノム研究インフラ、強力なバイオテクノロジーおよび製薬産業、分子生物学研究への投資の増加、そして創薬、精密医療、疾患研究におけるトランスクリプトミクス技術の普及拡大などが挙げられます。
米国は北米における主要市場である。強力なバイオテクノロジーのエコシステム、広範なゲノム研究活動、高度なシーケンス技術、そして多額の医薬品研究開発投資が、トランスクリプトミクス市場の成長を支え続けている。
カナダの確立されたライフサイエンス分野、ゲノム研究能力の向上、そして高度な分子解析技術の普及拡大は、地域市場の発展を引き続き支えている。
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アジア太平洋地域のトランスクリプトミクス市場は、世界市場の22.7%を占め、2025年には18億6,000万米ドルに達すると予測されており、予測期間中の年平均成長率（CAGR）は15.4%と見込まれています。この地域は、バイオテクノロジー産業の拡大、ヘルスケア投資の増加、ゲノム研究の進展、高度なシーケンス技術や分子解析技術の普及拡大などを背景に、上場市場の中で最も急速な成長を遂げています。
中国はアジア太平洋地域における主要市場の一つです。バイオテクノロジーおよび医薬品の研究開発の拡大、ゲノム研究の増加、そして高度なシーケンス技術への投資の拡大が、トランスクリプトミクス市場の成長を支え続けています。
日本の高度なライフサイエンス・エコシステム、強力な生物医学研究能力、そして分子解析技術の普及拡大は、トランスクリプトミクス・ソリューションへの需要を支え続けている。
インドの拡大するバイオテクノロジー分野、ゲノム研究能力の向上、そして高度な分子診断の普及拡大は、トランスクリプトミクス市場の発展に機会をもたらし続けている。
欧州のトランスクリプトミクス市場は世界市場の26.4%を占め、2025年には21億6,000万米ドルに達すると予測されており、予測期間中の年平均成長率（CAGR）は12.1%と見込まれています。この地域の成長は、ゲノミクスおよびバイオテクノロジー研究への投資増加、精密医療イニシアチブの拡大、そして高度なシーケンスおよびトランスクリプトミクス解析技術の普及拡大によって支えられています。
ドイツはヨーロッパにおける主要市場の一つである。強力な製薬・バイオテクノロジー産業、高度な研究インフラ、そして分子診断と精密医療への注力の高まりが、トランスクリプトミクスの普及を後押しし続けている。
英国における確立されたゲノム研究エコシステム、医薬品の研究開発能力、そして個別化医療への注目の高まりは、トランスクリプトミクス技術にとっての機会を継続的に生み出している。
ラテンアメリカのトランスクリプトミクス市場は、世界市場の5.1%を占め、2025年には4億2,000万米ドルに達すると予測されており、予測期間中の年平均成長率（CAGR）は10.6%と見込まれています。医療およびバイオテクノロジーへの投資の増加、ゲノム研究の拡大、分子解析技術の普及拡大などが、地域市場の発展を支え続けています。
ブラジルは主要な地域市場である。拡大を続けるバイオテクノロジーおよび生物医学研究分野、ゲノム研究活動の増加、そして高度なシーケンス技術の普及拡大が、トランスクリプトミクス市場の成長を支え続けている。
中東・アフリカ地域のトランスクリプトミクス市場は、世界市場の3.5%を占め、2025年には2億9,000万米ドルに達すると予測されており、予測期間中の年平均成長率（CAGR）は9.8%と見込まれています。医療インフラの整備、バイオテクノロジーおよびゲノミクスへの投資増加、そして高度な分子技術の普及拡大が、地域市場の拡大を支え続けています。
アラブ首長国連邦による先進医療、バイオテクノロジー、ゲノム研究への投資は、トランスクリプトミクス技術への需要を支え続けている。
サウジアラビアの医療近代化、成長するライフサイエンス・エコシステム、そしてゲノム医療への注目の高まりは、トランスクリプトミクス市場の発展に機会をもたらし続けている。
世界のトランスクリプトミクス市場は競争が激しく、ライフサイエンス、ゲノミクス、シーケンシング、分子生物学、バイオテクノロジー分野の大手企業が、RNAシーケンシング、マイクロアレイ技術、シングルセル・トランスクリプトミクス、空間トランスクリプトミクス、ライブラリー調製、バイオインフォマティクス、遺伝子発現解析ソリューションなどを通じてしのぎを削っています。市場の主要企業には、Pacific Biosciences of California Inc.、Thermo Fisher Scientific Inc.、Agilent Technologies Inc.、Illumina Inc.、QIAGEN、Bio-Rad Laboratories Inc.、Takara Bio Inc.、PerkinElmer Inc.、Fluidigm Corporation、F. Hoffmann-La Roche、Merck & Co. Inc.、Promega Corporation、RNA Connect、Becton, Dickinson and Company、Bio-Techne Corporationなどが挙げられます。
業界関係者は、研究者が遺伝子発現、RNA修飾、細胞の不均一性、分子経路をより高い感度と精度で分析できるようにする、ハイスループットかつ高解像度のトランスクリプトミクス技術の開発に注力しています。企業は、次世代シーケンシング、シングルセルRNAシーケンシング、空間トランスクリプトミクス、ロングリードシーケンス高度なサンプル調製技術やバイオインフォマティクスプラットフォームを活用し、トランスクリプトーム研究能力を拡大する。精密医療、がん研究、バイオマーカー発見、創薬、個別化治療に対する需要の高まりを受け、製薬会社、研究機関、バイオテクノロジー企業は高度なトランスクリプトーム技術の導入を進めている。
イルミナ社は、グローバルなトランスクリプトミクス市場をリードする企業の1つであり、次世代シーケンシングプラットフォーム、消耗品、ライブラリー調製技術、および情報科学ソリューションを提供することで、研究者が包括的なRNAシーケンシングと遺伝子発現解析を実施できるようにしています。同社のシーケンシング技術は、バルクRNAシーケンシング、シングルセル解析、トランスクリプトームプロファイリング、その他のゲノム研究ワークフローを含むアプリケーションをサポートしています。
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著者の詳細
Senior Research Associate
ダンシー・バプカー（Dhanshee Bhapkar）は、マーケットインテリジェンス分野で4年以上の経験を持つヘルスケア・リサーチの専門家です。医薬品、バイオ医薬品、医療機器の各セクターにおいて、市場分析、セカンダリ・リサーチ、市場規模の推計、および市場予測を専門としています。市場の力学、競合状況、業界動向、成長機会に関する実用的なインサイトを提供し、企業の戦略的な意思決定を支援しています。
トップダウン、ボトムアップ、疫学（EPI）ベースのアプローチなど、体系的な市場推計・予測手法を用いて、市場規模、成長の可能性、収益機会を評価する専門知識を有しています。また、疾患の疫学、治療の現状、市場動向、競合環境、業界の進展状況を分析し、精度の高い市場予測を策定してきた実務経験も豊富です。
臓器保存市場の規模、シェア、成長、分析、レポート、2034年
エピジェネティクス市場規模、シェア、成長率、分析、レポート、2034年
バイオバンク市場規模、シェア、成長率、2034年
臨床腫瘍学における次世代シーケンシング市場規模、2034年
自己免疫疾患診断市場の規模、シェア、成長率、2034年
大麻検査市場の規模、シェア、成長率、予測（2034年まで）
掲載実績：
sales@straitsresearch.com