01 向高分辨率鸟枪法宏基因组测序的转变日益明显 癌症微生物组测序市场正逐渐从基础的16S rRNA分析转向鸟枪法宏基因组测序，后者能够表征物种和菌株水平的微生物群落，同时还能识别功能基因和代谢通路。因此，高分辨率宏基因组学正成为癌症微生物组测序市场发展趋势的重要组成部分。 2025年9月，PacBio从数百份申请中遴选出4个项目，纳入其2025年微生物组SMRT资助计划。其中一个项目专门应用高保真鸟枪法宏基因组测序技术，对结直肠腺瘤患者的粪便样本进行测序，以重建宏基因组组装基因组，并研究微生物在结直肠癌进展中的作用。
02 将长读长测序技术更多地整合到肿瘤学工作流程中 癌症微生物组研究越来越需要能够解析复杂微生物基因组、结构变异和混合生物信号以及肿瘤相关分子信息的测序技术。长读长测序可以提供更完整的基因组组装，并提高使用片段化短读长难以表征的微生物的鉴定率。因此，将其与成熟的肿瘤富集和分析工作流程相结合，正推动癌症微生物组测序行业向更全面的转化研究方向发展。 2026年5月，牛津纳米孔技术公司扩展了其兼容的测序生态系统，涵盖肿瘤学、病原体和多组学工作流程。该项目新增了与安捷伦SureSelect靶向富集技术的兼容性，同时将实时、任意长度测序扩展到肿瘤学、病原体研究和多组学这三大主要领域。
01 越来越多的证据表明微生物群与癌症发展有关 研究人员正在识别肿瘤和胃肠道内可能存在的微生物群落。这增加了对细菌、真菌、病毒和其他微生物以及宿主和肿瘤信息进行测序的需求。随着微生物组特征与不同类型癌症的关联性日益增强，实验室需要越来越复杂的测序和计算工作流程。因此，肿瘤-微生物相互作用相关证据的不断积累正在推动癌症微生物组测序市场的需求增长。
01 宿主DNA含量高会增加测序成本 肿瘤组织、血液和其他人体样本中宿主DNA的含量可能远高于微生物DNA。如果在未有效去除宿主DNA的情况下对样本进行测序，则很大一部分测序读段可能代表的是人类遗传物质而非微生物，因此需要进行深度更深的测序才能获得足够的微生物信息。这会增加试剂、测序、存储和生物信息学成本。微生物丰度低会导致高质量肿瘤微生物组研究成本高昂，从而限制癌症微生物组测序市场的增长。
01 扩大微生物组测序在结直肠癌检测中的应用 结直肠癌的筛查具有重要意义，因为粪便样本能够以非侵入性的方式获取与胃肠道相关的微生物群落信息。对这些微生物群落进行测序，有望识别与癌前病变或癌症相关的微生物物种组合和功能特征。基于微生物组的筛查可以补充现有的粪便检测和结肠镜检查方法，同时支持更加个性化的风险评估。因此，非侵入性结直肠癌筛查有助于专业医疗机构提高癌症微生物组测序的市场份额。
01 解读复杂的多界微生物信号 癌症相关微生物群可能包含细菌、真菌、病毒、古菌和其他微生物，其丰度在不同患者、肿瘤类型、解剖部位、治疗方法和人群之间可能存在显著差异。仅检测微生物DNA并不能确定某种微生物是导致癌症的因素、对肿瘤微环境做出反应，还是仅仅是污染。因此，研究人员需要庞大的数据集和先进的生物信息学技术来区分有意义的生物学信号和背景变异。随着癌症微生物群测序市场规模向转化应用方向扩展，可靠的结果解读仍然是一项重大挑战。
2026年1月：Illumina公司推出了Connected Multiomics，这是一个基于云端的分析和解读平台，支持集成式多组学工作流程。该软件能够对复杂的生物数据集进行可扩展的分析和可视化，其应用领域包括肿瘤学和微生物组相关研究。
2025年5月：MapmyGenome收购了加拿大微生物测序专家Microbiome Insights，该公司拥有获得CAP认证的实验室和专注于微生物组的知识产权。此次收购扩展了MapmyGenome的微生物测序和微生物组分析能力，并加强了其国际基因组学业务。